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高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定主管部門：科技,、財(cái)政,、稅務(wù)部門；其他相關(guān)部門：環(huán)保,、質(zhì)量/安監(jiān),、審計(jì)等部門。每個(gè)部門所審查的要點(diǎn)不同,，如：科技部門會(huì)對(duì)企業(yè)技術(shù)領(lǐng)域是否屬于管理辦法或工作指引中的領(lǐng)域,、專利權(quán)屬及專利時(shí)效確認(rèn)、主要產(chǎn)品（服務(wù)）收入占高新收入比例是否超過(guò)50％,、申報(bào)前后各期數(shù)據(jù)對(duì)比及與高新年報(bào)數(shù)據(jù)對(duì)比、申報(bào)材料各項(xiàng)指標(biāo)核對(duì),；財(cái)政部門每年定期對(duì)承擔(dān)高企審計(jì)的事務(wù)所進(jìn)行底稿等風(fēng)險(xiǎn)檢查,，并抽選部分企業(yè)進(jìn)行延伸檢查、會(huì)計(jì)師事務(wù)所行業(yè)協(xié)會(huì)自律檢查,。

       其中科技部,、財(cái)政部,、稅務(wù)總局組成全國(guó)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作領(lǐng)導(dǎo)小組（以下稱“領(lǐng)導(dǎo)小組”），其主要職責(zé)為：

       （一）確定全國(guó)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作方向,，審議高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作報(bào)告,；

       （二）協(xié)調(diào)、解決認(rèn)定及相關(guān)政策落實(shí)中的重大問(wèn)題,；

       （三）裁決高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定事項(xiàng)中的重大爭(zhēng)議,，監(jiān)督、檢查各地區(qū)認(rèn)定工作,；

       （四）對(duì)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作出現(xiàn)重大問(wèn)題的地區(qū),，提出整改意見(jiàn)。

       領(lǐng)導(dǎo)小組下設(shè)辦公室,。辦公室設(shè)在科技部,，其主要職責(zé)為：

       （一）提交高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作報(bào)告；

       （二）組織實(shí)施對(duì)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作的檢查,；

       （三）負(fù)責(zé)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作的專家資格的備案管理,；

       （四）建立并管理“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”；

       （五）領(lǐng)導(dǎo)小組交辦的其他工作,。

       各省,、自治區(qū)、直轄市,、計(jì)劃單列市科技行政管理部門同本級(jí)財(cái)政,、稅務(wù)部門組成本地區(qū)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理機(jī)構(gòu)（以下稱“認(rèn)定機(jī)構(gòu)”），根據(jù)本辦法開(kāi)展下列工作：

       （一）負(fù)責(zé)本行政區(qū)域內(nèi)的高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作,；

       （二）接受企業(yè)提出的高新技術(shù)企業(yè)資格復(fù)審,；

       （三）負(fù)責(zé)對(duì)已認(rèn)定企業(yè)進(jìn)行監(jiān)督檢查，受理,、核實(shí)并處理有關(guān)舉報(bào),；

       （四）選擇參與高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作的專家并報(bào)領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案。

       企業(yè)取得高新技術(shù)企業(yè)資格后,，應(yīng)依照本辦法第四條的規(guī)定到主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理減稅,、免稅手續(xù)。

       享受減稅,、免稅優(yōu)惠的高新技術(shù)企業(yè),，減稅、免稅條件發(fā)生變化的,，應(yīng)當(dāng)自發(fā)生變化之日起15日內(nèi)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)告,；不再符合減稅、免稅條件的,，應(yīng)當(dāng)依法履行納稅義務(wù),；未依法納稅的,，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)予以追繳。同時(shí),，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)在執(zhí)行稅收優(yōu)惠政策過(guò)程中,，發(fā)現(xiàn)企業(yè)不具備高新技術(shù)企業(yè)資格的，應(yīng)提請(qǐng)認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核,。復(fù)核期間,，可暫停企業(yè)享受減免稅優(yōu)惠。

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